കോവിഡ് 19 രോഗനിർണയവും പരിശോധനാ സാങ്കേതിക വിദ്യകളും
2020 മെയ് അഞ്ചു വരെയുള്ള കണക്ക് അനുസരിച്ചു ആഗോളതലത്തില്‍ SARS-CoV-2 വൈറസ് മൂലമുണ്ടായ COVID-19 പാന്‍ഡെമിക് മൂലം 36 ലക്ഷത്തിലധികം കേസുകളിലായി 2,53,381 മരണങ്ങള്‍ സ്ഥിരികരീച്ചു. ഇത് നിങ്ങള്‍ വായിച്ചു തുടങ്ങുന്ന നിമിഷം മുതല്‍ മരണനിരക്ക് മാറികൊണ്ടിരിക്കുകയാണ്. വായിക്കാം, കോവിഡ് 19 രോഗനിര്‍ണ്ണയവും പരിശോധനാ സാങ്കേതിക വിദ്യകളും എവിടെ എത്തിനില്‍ക്കുന്നു എന്നു ബോധ്യപ്പെടുത്തുന്ന ഒരു ലേഖനം…
എഴുത്ത്: ഡോക്ടര്‍ പി. നിഖില്‍ ചന്ദ്ര, അസിസ്റ്റന്റ് പ്രൊഫസര്‍ ഓഫ് കെമിസ്ട്രി, എസ്.എന്‍. കോളേജ് കൊല്ലം- അവലംബം – ACS സെന്‍ട്രല്‍ സയന്‍സ്, 2020
ഒരു പക്ഷേ മാനവരാശിക്ക് ഇതുവരെ പരിചയമില്ലാത്ത രീതിയില്‍ ആഗോളതലത്തില്‍ കോവിഡ് 19 മനുഷ്യ ജീവനുകളെ മരണത്തിലേക്കു നയിക്കുന്നു. എന്നാല്‍ മനുഷ്യജീവനുകള്‍ക്കു മാത്രമല്ല കോവിഡ് ഭീഷണി ഉയര്‍ത്തിയിരിക്കുന്നത്. രോഗ വ്യാപനം തടയുന്നതിന്റെ ഭാഗമായി ലോകരാജ്യങ്ങളില്‍ അടച്ചുപൂട്ടല്‍ പ്രഖ്യാപിക്കുക വഴിയുണ്ടായ തൊഴില്‍ നഷ്ടവും ആഗോള സാമ്പത്തിക വ്യവസ്ഥയ്‌ക്കേറ്റ തിരിച്ചടിയും വരുന്ന കാലങ്ങളിലും പ്രതിസന്ധി സൃഷ്ടിക്കുക തന്നെ ചെയ്യും. ഇത്തരമൊരു സാഹചര്യത്തില്‍ കോവിഡിനെ പിടിച്ചു കെട്ടാന്‍ ലക്ഷ്യമിട്ട് ലോകത്തെമ്പാടും സജീവമായ നിരവധി പരീക്ഷണങ്ങളാണ് നടന്നുകൊണ്ടിരിക്കുന്നത്. ഇതില് ഏറ്റവും പ്രധാനം കോവിഡിനെ തിരിച്ചറിയാന്‍ ആവശ്യമായ ടെസ്റ്റ് കിറ്റുകള്‍ നിര്‍മ്മിക്കുക എന്നതു തന്നെയാണ്. ഇതിനായി ലബോറട്ടറികൾ, സർവ്വകലാശാലകൾ, ലോകമെമ്പാടുമുള്ള കമ്പനികൾ ആവശ്യമായ ടെസ്റ്റ് കിറ്റുകൾ നിർമ്മിക്കുക എന്ന ലക്ഷ്യവുമായി പരിശ്രമിച്ചു കൊണ്ടേയിരിക്കുന്നു.
പോസിറ്റീവ് ടെസ്റ്റിനെ അടിസ്ഥാനമാക്കി നിലവിൽ കണക്കാക്കിയതിനേക്കാൾ യഥാർത്ഥ SARS-CoV-2- ബാധിച്ച വ്യക്തികളുടെ എണ്ണം വളരെയധികം കൂടുതൽ ആകാം. നിശബ്‌ദമായ വ്യാപനം ഇല്ലാതാക്കാൻ കൃത്യവും സൗകര്യപ്രദവും വേഗത്തിലുള്ളതുമായ പരിശോധന നടത്തുക എന്നതു വളരെ പ്രധാനപ്പെട്ട കാര്യമാണ്. നേരിയ പനി പോലുള്ള ലക്ഷണങ്ങൾ മുതൽ ജീവൻ അപകടപ്പെടുത്തുന്ന അവസ്ഥ വരെ COVID-19 രോഗികൾ പ്രകടിപ്പിക്കുന്നതിനാൽ ആദ്യകാലങ്ങളിൽ കാര്യക്ഷമമായ പരിശോധന നടത്തേണ്ടത് പ്രധാനമാണ്.
കോവിഡ് പരിശോധനകള്‍ എങ്ങനെ
വാണിജ്യപരമായി ലഭ്യമായ COVID-19 ടെസ്റ്റുകൾ നിലവിൽ ഉൾപ്പെടുന്നതു രണ്ട് പ്രധാന രീതിയിലുള്ളവയാണ്. ആദ്യ വിഭാഗത്തിൽ SARS-CoV-2 വൈറൽ ആർ‌എൻ‌എ കണ്ടെത്തുന്നതിനായി പരിശോധനകൾ പോളിമറേസ് ചെയിൻ റിയാക്ഷൻ [(PCR) ഒരു പ്രത്യേക ഡി‌എൻ‌എ സാമ്പിളിന്റെ ദശലക്ഷക്കണക്കിന് കോടിക്കണക്കിന് പകർപ്പുകൾ അതിവേഗം ഉണ്ടാക്കുന്നതിനായി തന്മാത്രാ ജീവശാസ്ത്രത്തിൽ വ്യാപകമായി ഉപയോഗിക്കുന്ന ഒരു രീതിയാണ്] രീതിയോ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് (DNA,RNA യുടെയും അടിസ്ഥാന നിർമാണ ബ്ലോക്കുകളാണ് അവ) സീക്വൻസുകളുടെ അടിസ്ഥാന കണ്ടുപിടിക്കുന്ന രീതിയോ ആണ് അവലംബിക്കുന്നത്.
രണ്ടാമത്തെ വിഭാഗത്തിൽ ഉൾപ്പെടുന്നതു വൈറസ് അല്ലെങ്കിൽ രോഗം ബാധിച്ച വ്യക്തികളിൽ ആന്റിജനിക് പ്രോട്ടീനുകൾ (പുറത്തുള്ള ആക്രമണകാരികളോട് പോരാടുന്നതിന് നിങ്ങളുടെ രോഗപ്രതിരോധ ശേഷി ഉൽ‌പാദിപ്പിക്കുന്ന പ്രോട്ടീനാണ്) കണ്ടെത്തി മനസിലാക്കിയാണ്. ഒറ്റപ്പെട്ട ആർ‌എൻ‌എ ജീനോമുകളുള്ള പോസിറ്റീവ്-സെൻസ് വൈറസാണ് SARS-CoV-2 (പോസിറ്റീവ്-സെൻസ് വൈറൽ ആർ‌എൻ‌എ ജീനോമിന് മെസഞ്ചർ ആർ‌എൻ‌എ ആയി വർ‌ത്തിക്കാനും ഹോസ്റ്റ് സെല്ലിലെ പ്രോട്ടീനിലേക്ക് വിവർത്തനം ചെയ്യാനും കഴിയും), ഇതിന്റെ മുഴുവൻ ജനിതക ശ്രേണി മനസിലാക്കിയത് മുതൽ കമ്പനികളും ഗവേഷണ ഗ്രൂപ്പുകളും ഇതിനായുള്ള ഡയഗ്നോസ്റ്റിക് കിറ്റുകൾ വികസിപ്പിച്ചെടുത്തിട്ടുണ്ട്.
വൈറസിനെ കണ്ടെത്തുന്നതിനായുള്ള MOLECULAR പരിശോധാന രീതികൾ
- 1. Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction(RT-PCR) – ഒരു ചെറിയ സാമ്പിളിലെ വൈറൽ ജനിതക വസ്തുക്കളെ പല മടങ്ങു വര്‍ദ്ധിപ്പിക്കാനുള്ള കഴിവിനെ അടിസ്ഥാനപ്പെടുത്തിയുള്ള ടെസ്റ്റാണിത്.
- 2. lsothermal Nucleic Acid Amplification- RT -PCR നെ അപേക്ഷിച്ചു കൂടുതൽ ലളിതമായ ഇത് സ്ഥിരമായ താപനിലയിൽ ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ അനുവദിക്കുകയും ഒരു താപ സൈക്ലറിന്റെ ആവശ്യകത ഇല്ലാതെയും പ്രവർത്തിക്കുന്നു.
- 3. Nucleic Acid Hybridization Using Microarray- വൈറസിന്റെ ദ്രുത ഗതിയിലുള്ള കണ്ടെത്തലിനായി ഉപയോഗിക്കുന്ന രീതിയാണിത്. ഇതില് റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ ഉപയോഗിച്ച് വൈറൽ ആർ‌എൻ‌എയിൽനിന്ന് സിഡി‌എൻ‌എയുടെ ഉത്പാദനവും നിർദ്ദിഷ്ട പ്രോബുകളുള്ള സിഡി‌എൻ‌എയുടെ ലേബലിംഗും നടത്തി വൈറസുകളെ തിരിച്ചറിയുന്നു.
- 4. Amplicon-Based Metagenomic Sequencing- ഇതിൽ വൈറസുകളെ കണ്ടെത്താൻ Amplicon Metagenomic രീതികളെ സംയോജിപ്പിക്കുന്ന ഏകമുഖ രീതിയാണ്. നിർദ്ദിഷ്ട ജീനോമിക് പ്രദേശങ്ങളിലെ ജനിതക വ്യതിയാനം വിശകലനം ചെയ്യാൻ ഗവേഷകരെ പ്രാപ്തരാക്കുന്ന വളരെ ടാർഗെറ്റു ചെയ്‌ത സമീപനമാണ് ആംപ്ലിക്കോൺ അവലോകനം. കോടിക്കണക്കിന് ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് ശകലങ്ങൾ ഒരേസമയം സ്വതന്ത്രമായി ക്രമീകരിക്കാൻ കഴിയുന്ന അടുത്ത തലമുറ അവലോകന രീതികളിലൊന്നാണ് Metagenomic Sequencing
വൈറസിനെ കണ്ടെത്തുന്നതിനായുള്ള ഇമ്മ്യൂണോളജി-സീറോളജി പരിശോധാന രീതികൾ
ശരീരത്തിന്റെ രോഗപ്രതിരോധ സംവിധാനത്തെയും അതിന്റെ പ്രവർത്തനങ്ങളെയും വൈകല്യങ്ങളെയും കുറിച്ചുള്ള പഠനമാണ് ഇമ്മ്യൂണോളജി. രക്തത്തിലെ സെറം (രക്തം കട്ടപിടിക്കുമ്പോൾ വേർതിരിക്കുന്ന വ്യക്തമായ ദ്രാവകം) പഠനമാണ് സീറോളജി. ഈ രീതിയിൽ പ്രധാനമായും ആശ്രയിച്ചിരിക്കുന്നതു നമ്മുടെ ശരീരത്തിൽ IgM അല്ലെങ്കിൽ IgG ആന്റിബോഡികൾ, സ്പൈക്ക് ഗ്ലൈക്കോപ്രോട്ടീൻ (എസ് 1, എസ് 2 ഉപയൂണിറ്റുകൾ, റിസപ്റ്റർ-ബൈൻഡിംഗ് ഡൊമെയ്ൻ), അല്ലെങ്കിൽ ന്യൂക്ലിയോകാപ്സിഡ് പ്രോട്ടീൻ എന്നിവയുടെ അളവുകൾ നോക്കിയാണ്.
അവലംബം – ACS സെൻട്രൽ സയൻസ്, 2020
തയ്യാറാക്കിയത്: ഡോക്ടര്‍ പി. നിഖില്‍ ചന്ദ്ര, അസിസ്റ്റന്റ് പ്രൊഫസര്‍ ഓഫ് കെമിസ്ട്രി, എസ്.എന്‍. കോളേജ് കൊല്ലം
